Le 10 février 2026, Isomorphic Labs, société issue de Google DeepMind, a présenté l'Isomorphic Labs Drug Design Engine, abrégé IsoDDE. L'entreprise affirme qu'il dépasse AlphaFold 3, mais tous les résultats publiés sont les siens et aucune validation indépendante n'est mentionnée.
Un nom précis, pas « AlphaFold 4 »
Dans notre version initiale, le modèle était décrit comme un « type AlphaFold 4 » annoncé en août. Ni l'entreprise, ni la presse spécialisée que nous avons lue ne l'appellent ainsi : IsoDDE est présenté comme un système distinct d'AlphaFold 3, et l'annonce date de février. Isomorphic Labs le décrit comme un système unifié de conception de médicaments par ordinateur, avec un rapport technique public.
Ce que le système prétend faire
Selon la page de l'entreprise, IsoDDE prédit la structure de l'association entre une protéine et une petite molécule, ainsi que celle entre un anticorps et sa cible. Il estime aussi la force avec laquelle une molécule se fixe sur sa cible, et repère à partir de la seule séquence d'une protéine des poches où un médicament pourrait se lier, sans ligand connu au départ. L'entreprise écrit qu'il « plus que double » la précision d'AlphaFold 3 sur les cas les plus éloignés des données d'entraînement. Pour les complexes anticorps-antigène, elle annonce des performances 2,3 fois supérieures à AlphaFold 3 et 19,8 fois supérieures à Boltz-2 sur un ensemble de 334 cas peu similaires aux données d'apprentissage, dans le régime de plus haute fidélité. Pour la détection de poches, elle dit approcher les résultats d'une méthode expérimentale en laboratoire, en quelques secondes. Selon The Decoder, l'entreprise utilise le système au quotidien dans ses propres recherches de candidats médicaments.
Des résultats à confirmer
Plusieurs limites ressortent des deux sources. Toutes les performances proviennent de tests choisis par l'entreprise. La page ne donne pas de scores de précision absolus dans son texte, une partie des résultats figurant seulement dans des graphiques. Le gain de précision annoncé concerne les cas éloignés des données d'entraînement, pas l'ensemble des prédictions. La formule « approche » les expériences de laboratoire n'est pas chiffrée. Enfin, la page ne décrit ni accès public au modèle, ni code ouvert, ni conditions de licence. À la différence d'AlphaFold, dont les travaux ont été largement partagés, on ne sait donc pas comment des équipes extérieures pourraient le tester.
Prédire une structure ou une affinité ne dit pas encore qu'un médicament sera efficace chez l'humain. Ces systèmes aident à choisir des molécules à tester, qui doivent ensuite passer des essais cliniques.
À retenir
IsoDDE est un système de conception de médicaments annoncé le 10 février 2026 par Isomorphic Labs, présenté comme plus précis qu'AlphaFold 3 sur certains cas difficiles. Ces affirmations reposent uniquement sur les tests de l'entreprise, et le modèle ne semble pas accessible au public.